Крупнейший на Северо-Западе России организатор выставок
Скачайте наше приложение: для android для iOS
RU
EN
XIV ПЕТЕРБУРГСКИЙ МЕЖДУНАРОДНЫЙ ИННОВАЦИОННЫЙ ФОРУМ | САНКТ-ПЕТЕРБУРГ | ЭКСПОФОРУМ | 10-12 ноября 2021

Программу по поиску общих мутаций у бактерий сделали в Санкт-Петербурге

23.10.2021

Ученые Университета ИТМО разработали программу для быстрого выявления одинаковых мутаций у разных бактерий. Алгоритм для анализа генома поможет быстро выявлять тождественные изменения в их штаммах. Как сообщает пресс-служба ИТМО, программа, PaReBrick позволяет менее чем за минуту идентифицировать параллельные перестройки в бактериальных популяциях. Алгоритм умеет анализировать филогенетическое дерево, построенное для бактериальных штаммов, изучает схожие участки в геномах, автоматически находит нужные признаки и раскрашивает штаммы на филогенетическом дереве в определенный цвет в зависимости от состояния признака. Таким образом, формируется визуальное отображение информации о геноме. Алгоритм был протестирован на штаммах стрептококка – возбудителя пневмонии и кишечных палочках. Ранее подобные исследования проводили вручную, с помощью большого количества лабораторных экспериментов, что занимало много времени. Как уточняют в ИТМО, предложенный метод универсален и его можно применить в  области медицины, генной инженерии, а также в фундаментальных биологических исследованиях. В частности, алгоритм упростит изучение эволюционных механизмов бактерий, что позволит узнать потенциальные причины их устойчивости к антибиотикам.

Фото: depositphotos.com

Информационные партнеры

Мы в соцсетях

10-12 ноября 2021
КВЦ «Экспофорум»

Санкт-Петербург, Петербургское шоссе 64/1

ООО «ЭФ-Интернэшнл» 2021